SERVICES D'EXTRACTION D'ADN ET DE SÉQUENÇAGE CIBLÉ DE CINQ ESPÈCES DE PALMIERS D'AMAZONIE POUR LE PROJET ERC DOPAMICS

Le présent marché (Lot 1) a pour objet l'extraction de l'ADN génomique d'un minimum de 1500 spécimens de palmiers d'Amazonie à partir d'échantillons de feuilles, comprenant : - Extraction de l'ADN total, traitement RNAse A et Protéinase K, purification(s) éventuelle(s), - Dosage et contrôle qualité des ADNs génomiques extraits, - Expédition des ADNs génomiques extraits au titulaire du Lot 2 du marché (si différent du Titulaire du Lot 1). Les prestations et leurs modalités d'exécution sont décrites dans le CCAP et le CCTP du lot 1.

Le présent marché (Lot 2) a pour objet la réalisation de l'expérimentation de capture et le séquençage à haut débit d'un minimum de 1500 spécimens de palmiers d'Amazonie, comprenant : - Préparation des librairies individuelles, - Enrichissement ciblé par hybridation de sondes de capture avec un kit de capture sur mesure (technologie " myBAITS® Custom DNA-Seq" (Daicel Arbor Bioscience), - Séquençage à haut débit des librairies, - Contrôle qualité des données de séquençage. L'objectif de ce lot sera d'obtenir les données de séquençage avec une couverture de séquençage sur cible de 10X minimum par librairie.